2020-2024 Yılları Arasında Yürütücü ya da Araştırmacı Olarak Yer Aldığımız Projeler
Prof. Dr. Tunca Doğan
2022 - 2025 Üretken Derin Öğrenme ile Yeni Protein Dizilerinin Moleküler İşlev Odaklı Otomatik Tasarımı TÜBİTAK Projesi (Yürütücü)
2022 - 2025 Az Biyoaktif Bileşik Verisi Olan Proteinlere Karşı Sanal Tarama Için Derin Öğrenme Modelleri (Azderin) TÜBİTAK 1001 Projesi (Araştırmacı)
2021 - 2024 Biyomoleküler ve Biyomedikal Veri İçerisindeki Kompleks ve Heterojen İlişkilerin Bütünleyici Temsili ve Derin Çizge Öğrenme Bazlı Tahmini TÜBİTAK Projesi (Yürütücü)
2021 - 2024 Çekişmeli Çizge Üretici Derin Sinir Ağları ile Hastalık Hedefli Yeni İlaç Adayı Moleküllerin De Novo Tasarımı TÜBİTAK Projesi (Yürütücü)
2020 - 2022 Derin Öğrenme Bazlı Farmakogenomik Modelleme ile Geniş Çaplı Kanser Hücre Hattı İlaç Yanıt Tahmini TÜSEB (Yürütücü)
2019 - 2022 Kanserde İmmünoterapi Etkinliğinin İyileştirilmesine Yönelik Makine Öğrenmesine Dayalı Yeni Gen Keşfi ve İlaç Yeniden Konumlandırma Platformunun Geliştirilmesi TÜBİTAK 1003 projesi (Araştırmacı)
Dr. Öğretim Üyesi İdil Yet
2023 - 2025 Çoklu-Omik Yaklaşımlar Kullanılarak Bazı Antibiyotiklerin Çoklu Ilaç Direnci Gösteren Ve Aktif Efflux (Dışa Atım) Pompalarına Sahip Escherichia Coli Suşlarına Etkisinin Incelenmesi TÜBİTAK Projesi (Yürütücü)
2023 - 2025 Atopik Dermatit Hastalığında Yaygın Olan S. Aureus Ve Mrsa Enfeksiyonlarının Tedavisine Yönelik Yenilikçi Antimikrobiyal Peptitlerin Geliştirilmesi COST Projesi (Araştırmacı)
2024-2026 Osteoartritin Tanısı, Seyri Ve Tedavisinin İzlenmesi Amacıyla Fosfopeptit Zenginleştimesine Yönelik Yeni Bir İmmobilize Metal Afinite Kromatografisi (Imac) Sorbentinin Geliştirilmesi Ve Bu Sorbentin Hastalıklı Eklem Sıvısının Proteomik, Metabolomik Ve Lipidomik Araştırmalarında Kullanılarak Omik Haritalandırmanın Gerçekleştirilmesi COST Projesi (Danışman)
2023 - 2026 Leishmania Parazitleri ile Bakteriyel Mikrobiyom Arasındaki Ekstraselüler Vezikül Çeşitliliği ve İletişimi - Leishmaniasis Kontrolü İçin Yeni Mekanizmalar ve Stratejiler (Leishpath) COST Projesi (Araştırmacı)
2023 - Devam Ediyor Anadoludaki Nadir Otoinflamatuvar Hastalıklar ile İlişkili Mutasyonlar İçin Alel Yaşının Hesaplanması BAP Projesi (Yürütücü)
2022 - Devam Ediyor Türkiyedeki Başlıca Monofloral Bal Çeşitlerinin Proteomik ve Metabolomik Yaklaşımı İle İncelenmesi TÜBİTAK 1001 221Z059 numaralı Ek Bütçe Desteği ) BAP Projesi (Araştırmacı)
2021 - Devam Ediyor Türkiyedeki Bazı Monofloral Balların ve Bal Üzerinde Arı Irkı Etkilerinin GCMS Temelli Metabolomik ve Foodomik Yaklaşım ile İncelenmesi BAP Projesi (Araştırmacı)
2023 - 2026 Konak-Patojen İlişkisine Antik Holobiyomlarla Bakış: Diş Çürümesi ile İlişkili Genetik Yapının ve İnsan Ağız Mikrobiyatasının Temporal Değişiminin ve Etkileşiminin Antik DNA ile Araştırılması TÜBİTAK Projesi (Araştırmacı)
2022 - 2025 Türkiye'deki Başlıca Monofloral Bal Çeşitlerinin Proteomik ve Metabolomik Yaklaşımı ile İncelenmesi TÜBİTAK Projesi (Araştırmacı)
2022 - 2024 Kompleks hastalıklarla ilişkili genetik varyasyonun zamanserisi genom dizileme verilerinde popülasyon genetiği yaklaşımları ile incelenmesi BAP Projesi (Yürütücü)
2020 - 2021Bayes ağlarını kullanarak karaciğer kanserinin tekil hücresinin omikler arasındaki ilişkisinin belirlenmesi L'oreal Women in Science Projesi (Yürütücü)
Dr. Öğretim Üyesi Gülşah Merve Kılınç
2023 - 2026 Konak-Patojen İlişkisine Antik Holobiyomlarla Bakış: Diş Çürümesi ile İlişkili Genetik Yapının ve İnsan Ağız Mikrobiyatasının Temporal Değişiminin ve Etkileşiminin Antik DNA ile Araştırılması TÜBİTAK Projesi (Yürütücü)
2021 - 2024 Obezite ve Tip 2 Diyabet ile İlişkili Genetik Yapının Anadolu`da Son 10.000 Yıl İçindeki Değişim Dinamiklerinin Antik DNA ve Popülasyon Genetiği Yaklaşımları ile Incelenmesi TÜBİTAK Projesi (Yürütücü)
2023 - 2025 Çoklu-Omik Yaklaşımlar Kullanılarak Bazı Antibiyotiklerin Çoklu Ilaç Direnci Gösteren Ve Aktif Efflux (Dışa Atım) Pompalarına Sahip Escherichia Coli Suşlarına Etkisinin Incelenmesi TÜBİTAK Projesi (Danışman)
2024 - Devam Ediyor Huzursuz bağırsak sendromu ile ilişkili genetik yapının antik DNA ile araştırılması BAP Projesi (Yürütücü)
2024 - Devam Ediyor ÇokluOmik Yaklaşımlar Kullanılarak Bazı Antibiyotiklerin Çoklu Ilaç Direnci Gösteren Ve Aktif Efflux Dışa Atım Pompalarına Sahip Escherichia Coli Suşlarına Etkisinin Incelenmesi (3501 TUBİTAK 123Z170 proje nosu ile EK proje desteği başvurusu) BAP Projesi (Araştırmacı)
2022 - 2025 İznik İnsanları ve Bizansın Savaşçıları: Biyoarkeolojik Bir Araştırma (İBİS) TÜBİTAK Projesi (Araştırmacı)
2022 - 2025 Neolitik Dönemden Orta Çağa Anadolu Kafkas İlişkileri: Anadolu Ve Azerbaycan İnsan Kalıntıları Üzerine Arkeogenomik Bir Araştırma TÜBİTAK Projesi (Danışman)
2022 - 2024 Kompleks hastalıklarla ilişkili genetik varyasyonun zamanserisi genom dizileme verilerinde popülasyon genetiği yaklaşımları ile incelenmesi BAP Projesi (Araştırmacı)
2021 - 2022 DOCK8 eksikliği olan hastalarda immün repertuvarın belirlenmesi BAP Projesi (Araştırmacı)
2023 - 2025 Primer T Hücre Yetmezliklerinde, Immün Sistemde Spesifik Rolleri Olan Nadir Lenfosit Alt Gruplarının Yeni Nesil Tek Hücre Dizileme ile Transkriptom Analizi TÜBİTAK Projesi (Araştırmacı)
Dr. Öğretim Üyesi Arda Çetinkaya
2020 - 2023 Konjenital Kemik İliği Yetmezliği Sendromlarında Genetik Etiyolojinin Araştırılması Ve Translasyon Tayini (Riboeurope) TÜBİTAK Projesi (Yürütücü)
2020 - 2021Trombositopeni Ağırlıklı Shwachman-Diamond Sendromunda Ekzositoz İle İlişkili Yeni Gen Keşfi (Yürütücü)